過期或變質藥物。藥品都有保質期，根據藥物的穩定性，其保質期有的長有的短。一旦超過保質期，則藥物的效價就會變差。管理混亂的豬場，一次性購進大量藥品，在倉庫里不知存放了多長時間，想用的時候可能已經過了有效期。
不安要求保存。如生物制品一般要求低溫(常在2~8℃)保存，大部分獸藥的保存條件是密封、避光和陰涼。有些藥物見光分解，有些藥物遇熱失效，有些藥物容易吸潮。曾經有豬場將開封的消毒藥放置在強烈陽光下。
用藥劑量不足。對已發病的豬群用預防劑量，不能達到預期治療效果，延誤了治療時機。在豬發病后，采食量明顯降低的情況下使用常規劑量的藥物也是用藥不足 的一種常見情況;母豬在限飼的情況下用藥，常規劑量添加也達不到用藥效果。有些養豬企業為了降低用藥成本，不按說明書或者不按指導用藥，將推薦劑量減半使 用，從而難以發揮應有的效果，也是造成浪費的原因之一。有些豬場的獸醫基礎理論知識欠缺，或者責任心不強，算錯用藥劑量(很多將10%或20%的制劑當作 純粉添加)，劑量肯定不足。當然也不排除有些藥品生產企業為了讓用戶從價格上接受，故意推薦低劑量。
用藥過量。有些豬場認為，要盡快達到治療效果，大劑量用藥可以提高療效，在很多情況下是這樣，因為有些抗生素具有濃度依賴性殺菌效果。但若藥物的安全范圍窄，則可能出現嚴重的副作用甚至中毒現象。因為是藥三分毒。
療程不足。一般情況下，抗生素需要連用幾天，個別疾病的治療甚至需要至少半個月。在注射給藥時最常發生療程不夠，因為獸醫、飼養員都喜歡少干活。抗生素 的作用是抑制細菌的增殖，依靠機體將細菌清除。使用一次或幾次抗生素有可能癥狀緩解，但體內仍有細菌存在，停藥后這些細菌有可能復活，并大量繁殖。所以， 一般疾病的治療需要在臨床癥狀消失后繼續使用抗生素1~2天。